MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Pyrococcus sp. ST04 chromosome

Total Repeats: 32038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017946	CTC	3	9	437	445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851450
2	NC_017946	TCA	2	6	525	530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851450
3	NC_017946	TC	3	6	571	576	0 %	50 %	0 %	50 %	389851450
4	NC_017946	AC	3	6	681	686	50 %	0 %	0 %	50 %	389851450
5	NC_017946	TGGTTT	2	12	875	886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389851450
6	NC_017946	TCC	2	6	895	900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851450
7	NC_017946	TCCT	2	8	1228	1235	0 %	50 %	0 %	50 %	389851451
8	NC_017946	TCT	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851451
9	NC_017946	CTC	2	6	1305	1310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851451
10	NC_017946	TTCT	2	8	1319	1326	0 %	75 %	0 %	25 %	389851451
11	NC_017946	CT	3	6	1341	1346	0 %	50 %	0 %	50 %	389851451
12	NC_017946	CAA	2	6	1441	1446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851451
13	NC_017946	TCCT	2	8	1453	1460	0 %	50 %	0 %	50 %	389851451
14	NC_017946	CT	3	6	1466	1471	0 %	50 %	0 %	50 %	389851451
15	NC_017946	CT	3	6	1667	1672	0 %	50 %	0 %	50 %	389851451
16	NC_017946	TTA	2	6	1673	1678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851451
17	NC_017946	TTC	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851451
18	NC_017946	TC	3	6	1747	1752	0 %	50 %	0 %	50 %	389851451
19	NC_017946	CCT	2	6	1817	1822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851451
20	NC_017946	AT	3	6	1896	1901	50 %	50 %	0 %	0 %	389851451
21	NC_017946	AAG	2	6	2028	2033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851451
22	NC_017946	TG	3	6	2035	2040	0 %	50 %	50 %	0 %	389851451
23	NC_017946	TC	3	6	2079	2084	0 %	50 %	0 %	50 %	389851451
24	NC_017946	CTAT	2	8	2149	2156	25 %	50 %	0 %	25 %	389851451
25	NC_017946	CCA	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389851451
26	NC_017946	TTC	2	6	2227	2232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851451
27	NC_017946	GTA	3	9	2250	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851451
28	NC_017946	TG	3	6	2267	2272	0 %	50 %	50 %	0 %	389851451
29	NC_017946	TCT	2	6	2302	2307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851451
30	NC_017946	GAA	2	6	2330	2335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851451
31	NC_017946	CTAA	2	8	2341	2348	50 %	25 %	0 %	25 %	389851451
32	NC_017946	TTC	2	6	2352	2357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851451
33	NC_017946	TCAT	2	8	2389	2396	25 %	50 %	0 %	25 %	389851451
34	NC_017946	CAT	2	6	2526	2531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851451
35	NC_017946	TAT	2	6	2532	2537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851451
36	NC_017946	GAT	2	6	2543	2548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851451
37	NC_017946	AGC	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389851451
38	NC_017946	TCA	2	6	2669	2674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851451
39	NC_017946	TCG	2	6	2705	2710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389851451
40	NC_017946	CTT	3	9	2712	2720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851451
41	NC_017946	CTT	2	6	2743	2748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851451
42	NC_017946	AG	3	6	2793	2798	50 %	0 %	50 %	0 %	389851451
43	NC_017946	TATCTT	2	12	2820	2831	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	389851451
44	NC_017946	TCC	2	6	2839	2844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851451
45	NC_017946	TCC	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851451
46	NC_017946	CAA	2	6	2876	2881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851451
47	NC_017946	TCC	2	6	2896	2901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851451
48	NC_017946	AGT	2	6	3054	3059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851452
49	NC_017946	CAA	2	6	3070	3075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851452
50	NC_017946	CAG	2	6	3136	3141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389851452
51	NC_017946	GCTA	2	8	3144	3151	25 %	25 %	25 %	25 %	389851452
52	NC_017946	GAC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389851452
53	NC_017946	AGTA	2	8	3230	3237	50 %	25 %	25 %	0 %	389851452
54	NC_017946	AG	3	6	3261	3266	50 %	0 %	50 %	0 %	389851452
55	NC_017946	CTC	2	6	3267	3272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851452
56	NC_017946	TAA	2	6	3298	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389851452
57	NC_017946	A	6	6	3320	3325	100 %	0 %	0 %	0 %	389851452
58	NC_017946	GAA	2	6	3616	3621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851452
59	NC_017946	TTAT	2	8	4315	4322	25 %	75 %	0 %	0 %	389851453
60	NC_017946	AT	3	6	4321	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	389851453
61	NC_017946	AAAGA	2	10	4361	4370	80 %	0 %	20 %	0 %	389851453
62	NC_017946	CCT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851453
63	NC_017946	TAT	2	6	4611	4616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851453
64	NC_017946	AGG	2	6	4640	4645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851453
65	NC_017946	A	6	6	4657	4662	100 %	0 %	0 %	0 %	389851453
66	NC_017946	GGC	2	6	4738	4743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	389851453
67	NC_017946	CT	3	6	4784	4789	0 %	50 %	0 %	50 %	389851453
68	NC_017946	CCT	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851453
69	NC_017946	TGTA	2	8	4940	4947	25 %	50 %	25 %	0 %	389851453
70	NC_017946	GAA	2	6	4978	4983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851453
71	NC_017946	TAC	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851453
72	NC_017946	TAT	2	6	5115	5120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851454
73	NC_017946	CTC	2	6	5161	5166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851454
74	NC_017946	AAT	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389851454
75	NC_017946	ATTA	2	8	5206	5213	50 %	50 %	0 %	0 %	389851454
76	NC_017946	TCT	2	6	5229	5234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851454
77	NC_017946	T	6	6	5256	5261	0 %	100 %	0 %	0 %	389851454
78	NC_017946	TC	3	6	5284	5289	0 %	50 %	0 %	50 %	389851454
79	NC_017946	CCT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851454
80	NC_017946	CAA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851454
81	NC_017946	ACAA	2	8	5329	5336	75 %	0 %	0 %	25 %	389851454
82	NC_017946	TC	3	6	5407	5412	0 %	50 %	0 %	50 %	389851454
83	NC_017946	AT	3	6	5416	5421	50 %	50 %	0 %	0 %	389851454
84	NC_017946	GTC	2	6	5443	5448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389851454
85	NC_017946	TTTTC	2	10	5464	5473	0 %	80 %	0 %	20 %	389851454
86	NC_017946	AAG	2	6	5649	5654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851455
87	NC_017946	A	6	6	5713	5718	100 %	0 %	0 %	0 %	389851455
88	NC_017946	G	6	6	5769	5774	0 %	0 %	100 %	0 %	389851455
89	NC_017946	TTG	2	6	5778	5783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389851455
90	NC_017946	CTC	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851455
91	NC_017946	TTC	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851455
92	NC_017946	CCG	2	6	5961	5966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389851455
93	NC_017946	GATA	2	8	6049	6056	50 %	25 %	25 %	0 %	389851455
94	NC_017946	GGA	2	6	6071	6076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851455
95	NC_017946	ATA	2	6	6152	6157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389851455
96	NC_017946	AGG	2	6	6207	6212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851455
97	NC_017946	ATG	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851455
98	NC_017946	A	6	6	6290	6295	100 %	0 %	0 %	0 %	389851455
99	NC_017946	TAGAC	2	10	6307	6316	40 %	20 %	20 %	20 %	389851455
100	NC_017946	AC	3	6	6315	6320	50 %	0 %	0 %	50 %	389851455
101	NC_017946	AAG	2	6	6328	6333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851455
102	NC_017946	AGG	2	6	6415	6420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851455
103	NC_017946	GGA	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851455
104	NC_017946	TAG	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851455
105	NC_017946	AG	3	6	6552	6557	50 %	0 %	50 %	0 %	389851455
106	NC_017946	GAA	2	6	6570	6575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851455
107	NC_017946	GA	3	6	6635	6640	50 %	0 %	50 %	0 %	389851455
108	NC_017946	CT	3	6	6669	6674	0 %	50 %	0 %	50 %	389851455
109	NC_017946	ATA	2	6	6683	6688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389851455
110	NC_017946	AG	3	6	6725	6730	50 %	0 %	50 %	0 %	389851455
111	NC_017946	GAAT	2	8	6779	6786	50 %	25 %	25 %	0 %	389851455
112	NC_017946	CCT	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851456
113	NC_017946	TCG	2	6	6914	6919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389851456
114	NC_017946	TGC	2	6	7168	7173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389851457
115	NC_017946	TTC	2	6	7176	7181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851457
116	NC_017946	CCA	2	6	7229	7234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389851457
117	NC_017946	TCA	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851457
118	NC_017946	TCA	2	6	7268	7273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851457
119	NC_017946	TTA	2	6	7331	7336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851457
120	NC_017946	TAT	2	6	7354	7359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851457
121	NC_017946	CTC	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851457
122	NC_017946	TCT	2	6	7446	7451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851457
123	NC_017946	ACCCT	2	10	7469	7478	20 %	20 %	0 %	60 %	389851457
124	NC_017946	TCA	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851457
125	NC_017946	A	6	6	7510	7515	100 %	0 %	0 %	0 %	389851457
126	NC_017946	CTTC	2	8	7533	7540	0 %	50 %	0 %	50 %	389851457
127	NC_017946	TCT	3	9	7574	7582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389851457
128	NC_017946	ACG	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389851457
129	NC_017946	ACA	2	6	7667	7672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389851457
130	NC_017946	CTTT	2	8	7674	7681	0 %	75 %	0 %	25 %	389851457
131	NC_017946	TAT	2	6	7687	7692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389851457
132	NC_017946	TA	3	6	7763	7768	50 %	50 %	0 %	0 %	389851457
133	NC_017946	GAG	2	6	7795	7800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389851457
134	NC_017946	CAT	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389851457
135	NC_017946	GAA	2	6	7848	7853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389851457
136	NC_017946	CTC	2	6	7986	7991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389851457
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262	NC_017946	ATA	2	6	15400	15405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389851464
263	NC_017946	AGT	2	6	15447	15452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389851464
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